Introducción

En la tarea se tarbajan con cuatro especies de monitos en Costa Rica.

Monito Araña,Los monos araña tienen extremidades extremadamente largas y colas prensiles. Las colas tienen puntas sin pelo y surcos que se asemejan a huellas dactilares. Los monos tienen cabezas pequeñas con caras sin pelo y fosas nasales anchas.

Monito Ardilla,un primate neotropical perteneciente a la familia Cebidae, posee cola larga, no prensil, con la porción terminal de color negro..

Monito Aullador,se caracterizan porque tienen un hueso hioides desarrollado para realizar esas potentes llamadas, pues este actúa como caja de resonancia natural.

Monito carablanca,muy valioso por su papel como dispersor de semillas y polen.Mono de tamaña mediano.

Se desaroolaran diferentes diseños por los cuales se vizualizaran los datos registrados de estos incluyendo ubicando (provincia y cantón)

# Tabla de registros de presencia
monitos %>%
  st_drop_geometry() %>%
  dplyr::select(family, species, stateProvince, locality, eventDate) %>%
  datatable(
    colnames = c("Familia", "Especies", "Provincia", "Localidad", "Fecha"),
    options = list(
      searchHighlight = TRUE,
      language = list(url = '//cdn.datatables.net/plug-ins/1.10.11/i18n/Spanish.json')
    )
  )

Tabla de registros

Gráfico de Registros por especie

monitos %>%
  plot_ly(
    labels = ~ tipos,
    values = ~ cantidad,
    type = "pie",
    textposition = "inside",
    textinfo = "label+percent"
  ) %>%
  config(locale = "es") %>%
  layout(
    title = "Numero de monitos",
    xaxis = list(
      showgrid = FALSE,
      zeroline = FALSE,
      showticklabels = FALSE
    ),
    yaxis = list(
      showgrid = FALSE,
      zeroline = FALSE,
      showticklabels = FALSE
    )
  )

## Warning: 'pie' objects don't have these attributes: 'x', 'y', 'mode'
## Valid attributes include:
## 'type', 'visible', 'showlegend', 'legendgroup', 'opacity', 'name', 'uid', 'ids', 'customdata', 'meta', 'hoverlabel', 'stream', 'transforms', 'uirevision', 'labels', 'label0', 'dlabel', 'values', 'marker', 'text', 'hovertext', 'scalegroup', 'textinfo', 'hoverinfo', 'hovertemplate', 'texttemplate', 'textposition', 'textfont', 'insidetextorientation', 'insidetextfont', 'outsidetextfont', 'automargin', 'title', 'domain', 'hole', 'sort', 'direction', 'rotation', 'pull', '_deprecated', 'idssrc', 'customdatasrc', 'metasrc', 'labelssrc', 'valuessrc', 'textsrc', 'hovertextsrc', 'hoverinfosrc', 'hovertemplatesrc', 'texttemplatesrc', 'textpositionsrc', 'pullsrc', 'key', 'set', 'frame', 'transforms', '_isNestedKey', '_isSimpleKey', '_isGraticule', '_bbox'

Creación de los filtros

Araña <- monitos %>%
  dplyr::select(species,
                stateProvince,
                locality,
                eventDate,
                decimalLatitude,
                decimalLongitude) %>%
  filter(species == 'Ateles geoffroyi')

Carablanca <- monitos %>%
  dplyr::select(species,
                stateProvince,
                locality,
                eventDate,
                decimalLatitude,
                decimalLongitude) %>%
  filter(species == 'Cebus capucinus')

Aullador <- monitos %>%
  dplyr::select(species,
                stateProvince,
                locality,
                eventDate,
                decimalLatitude,
                decimalLongitude) %>%
  filter(species == 'Alouatta palliata')

Ardilla <- monitos %>%
  dplyr::select(species,
                stateProvince,
                locality,
                eventDate,
                decimalLatitude,
                decimalLongitude) %>%
  filter(species == 'Saimiri oerstedii')

Creación de la capa altitud

alt <- getData(
  "worldclim",
  var = "alt",
  res = .5,
  lon = -84,
  lat = 10
)
altitud <-
  alt %>%
  crop(provincias) %>%
  mask(provincias)

Colores de la capa

rcol <- colorNumeric(c("#DA70D6", "#800080", "#4682B4"),
                     values(altitud),
                     na.color = "transparent")

Popups de cada especie

monito_araña <- paste0(
  "<b>",
  "Especie del primate: ",
  "</b>",
  (Araña$species),
  "<br>",
  "<b>",
  "Provincia: ",
  "</b>",
  (Araña$stateProvince),
  "<br>",
  "<b>",
  "CantÃ³n: ",
  "</b>",
  (Araña$locality),
  "<br>",
  "<b>",
  "Fecha: ",
  "</b>",
  (Araña$eventDate),
  "<br>",
  "<b>",
  "Cordenadas: " ,
  "</b>",
  (Araña$decimalLongitude),
  "<br>",
  (Araña$decimalLatitude)
)
monito_ardilla <- paste0(
  "<b>",
  "Especie del primate: ",
  "</b>",
  (Ardilla$species),
  "<br>",
  "<b>",
  "Provincia: ",
  "</b>",
  (Ardilla$stateProvince),
  "<br>",
  "<b>",
  "CantÃ³n: ",
  "</b>",
  (Ardilla$locality),
  "<br>",
  "<b>",
  "Fecha: ",
  "</b>",
  (Ardilla$eventDate),
  "<br>",
  "<b>",
  "Cordenadas: " ,
  "</b>",
  (Ardilla$decimalLongitude),
  "<br>",
  (Ardilla$decimalLatitude)
)
monito_aullador <- paste0(
  "<b>",
  "Especie del primate: ",
  "</b>",
  (Aullador$species),
  "<br>",
  "<b>",
  "Provincia: ",
  "</b>",
  (Aullador$stateProvince),
  "<br>",
  "<b>",
  "CantÃ³n: ",
  "</b>",
  (Aullador$locality),
  "<br>",
  "<b>",
  "Fecha: ",
  "</b>",
  (Aullador$eventDate),
  "<br>",
  "<b>",
  "Cordenadas: " ,
  "</b>",
  (Aullador$decimalLongitude),
  "<br>",
  (Aullador$decimalLatitude)
)
monito_carablanca <- paste0(
  "<b>",
  "Especie del primate: ",
  "</b>",
  (Carablanca$species),
  "<br>",
  "<b>",
  "Provincia: ",
  "</b>",
  (Carablanca$stateProvince),
  "<br>",
  "<b>",
  "CantÃ³n: ",
  "</b>",
  (Carablanca$locality),
  "<br>",
  "<b>",
  "Fecha: ",
  "</b>",
  (Carablanca$eventDate),
  "<br>",
  "<b>",
  "Cordenadas: " ,
  "</b>",
  (Carablanca$decimalLongitude),
  "<br>",
  (Carablanca$decimalLatitude)
)

Creación del Mapa

monitos %>%
  leaflet() %>%
  addProviderTiles(providers$OpenStreetMap.Mapnik, group = "OpenStreetMap") %>%
  addProviderTiles(providers$Stamen.TonerLite, group = "Stamen Toner Lite") %>%
  addProviderTiles(providers$Esri.WorldImagery, group = "Imágenes de ESRI") %>%
  addRasterImage(altitud,
                 colors = rcol,
                 opacity = 0.8,
                 group = "Altitud") %>%
  addCircleMarkers(
    data = Araña,
    stroke = F,
    radius = 4,
    fillColor = '#7B68EE',
    fillOpacity = 1,
    popup = monito_araña,
    group = "Ateles geoffroyi"
  ) %>%
  addCircleMarkers(
    data = Ardilla,
    stroke = F,
    radius = 4,
    fillColor = '#9ACD32',
    fillOpacity = 1,
    popup = monito_ardilla,
    group = "Saimiri oerstedii"
  ) %>%
  addCircleMarkers(
    data = Aullador,
    stroke = F,
    radius = 4,
    fillColor = '#F4A460',
    fillOpacity = 1,
    popup = monito_aullador,
    group = "Alouatta palliata"
  ) %>%
  addCircleMarkers(
    data = Carablanca,
    stroke = F,
    radius = 4,
    fillColor = '#48D1CC',
    fillOpacity = 1,
    popup = monito_carablanca,
    group = "Cebus capucinus"
  ) %>%
  addLayersControl(
    baseGroups = c("OpenStreetMap", "Stamen Toner Lite", "Imágenes de ESRI"),
    overlayGroups = c(
      "Ateles geoffroyi",
      "Cebus capucinus",
      "Alouatta palliata",
      "Saimiri oerstedii",
      "altitud"
    )
  ) %>%
  addMiniMap(
    tiles = providers$Stamen.OpenStreetMap.Mapnik,
    position = "bottomleft",
    toggleDisplay = TRUE
  )

Tarea_03

Carga de documentos

Asignación de CRS